La basilique aussi appelée cathédrale Saint-Thomas a été construite en 1891 sur le tombeau de l’un des douze apôtres de Jésus-Christ. Saint Thomas était arrivé en Inde en l’an 52 pour répandre la « bonne nouvelle ». Il y est mort en martyre en l’an 72, sur le Mont Saint Thomas au sud ouest de la ville.
Sous la basilique d’un blanc immaculé, se trouve une chapelle souterraine. Il n’existe que deux autres basiliques au monde autres que la cathédrale de Santhome, ayant été construites sur la tombe d’un apôtre. L’une d’elles étant «la basilique Saint-Pierre» à Rome et l’autre étant «l’église de Saint-Jacques le Grand», à Saint-Jacques-de-Compostelle, en Espagne.